Chemie se vyučuje na víceletém gymnáziu od třídy sekundy až do třídy septimy. Na čtyřletém gymnáziu se učí od prvního do třetího ročníku. V oktávě a čtvrtém ročníku se vyučuje volitelný předmět Seminář a cvičení z chemie, který je zaměřen na přípravu studentů k vysokoškolskému studiu chemie.
Na nižším gymnáziu se chemie vyučuje ve dvou hodinách týdně, laboratorní cvičení se zařazují nad rámec výuky, zhruba pětkrát do roka. Na vyšším gymnáziu (kvinta až septima, první až třetí ročník)je teoretická výuka dvě hodiny týdně. Laboratorní cvičení je zařazeno v dvouhodinových blocích jedenkrát za čtrnáct dnů ve třídách kvinta, sexta a první ročník. Dvouhodinové laboratorní cvičení jedenkrát za tři týdny je zařazeno do druhého a třetího ročníku. V závěrečných ročnících je možné laboratorní cvičení zařadit do výuky zmíněného semináře.
Výuka probíhá v učebně chemie, která je nově vybavena interaktivní tabulí SMART BOARD s přístupem na internet. Je zde částečně zachován i původní televizní okruh. Laboratorní cvičení probíhá v samostatné laboratoři chemie, která je standardně vybavena. K vybavení patří váhovna opatřená novými digitálními váhami a přípravna chemikálií pro vyučující.
Učebnice, které používáme, jsou z ucelené řady autorů Mareček-Honza: Chemie pro čtyřletá gymnázia, 1. až 3. díl. Nakladatelství Olomouc, 1998-2000. Patří sem i Sbírka úloh a příkladů a další cvičebnice. Na nižším gymnáziu používáme učebnice Základy chemie 1 a 2, Fortuna, a příslušné pracovní sešity.
Chemii na naší škole zajišťuje Mgr. Halina Vysopalová a Mgr. Andrea Koníčková
Každoročně zadáváme ve všech ročních chemickou olympiádu, v letošním roce probíhá již 44. ročník. Vzhledem k náročnosti zadávaných úloh vyšších kategorií se tradičně hlásí nejvíce studentů v nižších ročnících. Další zajímavou akcí, kterou propagujeme, je Korespondenční Seminář Inspirovaný Chemickou Tematikou – KSICHT, pořádaný studenty Vysoké školy chemicko-technologické v Praze. S touto vysokou školou máme dobré vztahy, vyučující každoročně absolvují týdenní školu chemie o prázdninách, naši studenti jezdí na zajímavé přednášky pořádané touto školou a studenti 4. ročníku a oktávy jezdí spolu s vyučující na Dny otevřených dveří.V loňském roce tým asistentů z VŠCHT předváděl na naší škole netradiční chemické pokusy, což se ukázalo býti podnětným pro mnohé studenty.